В СЕВ используется сервер СЕВ, получающий сигналы от приёмника GPS/ГЛОНАСС и производящий фильтрацию и плавную настройку часов сервера. Клиенты СЕВ получают данные по протоколу NTP.

Программа синхронизации обеспечивает измерение и контроль временных разностей, что позволяет подтвердить заданную точность синхронизации с системой единого времени.